El script de actualización no respetó la versión de app.yml, todavía en beta

Por defecto, la fila version: va precedida de un #

¿La eliminaste antes de reconstruir?

El # comenta la línea; si está presente, seguirá usando el valor predeterminado para version:, que es tests-passed.

Hay muy poco beneficio en estar en stable; siempre que pruebes las versiones antes de actualizar tu sitio en vivo, probablemente no sea algo malo.