Estoy viendo el error de MathJax “Nidificación errónea de estructuras de ecuaciones” cuando uso \begin{align}...\end{align} dentro de $$...$$. Esto parece ser MathJax aplicando de forma más estricta la regla de “no anidar entornos de ecuaciones” durante el trabajo de actualización a la versión 4.
En la práctica, el patrón fiable de Discourse es usar aligned dentro del envoltorio $$:
$$
{\large
\begin{aligned}
a &= b \\
&= c
\end{aligned}
}
$$
Esto evita anidar una estructura de ecuación de visualización (align) dentro de otro envoltorio de visualización ($$...$$), que es lo que desencadena el error.