Скорее всего, будет проще управлять этим, если вы создадите символическую ссылку на файлы GeoIP в /var/www/discourse/vendor/data на отдельный том, содержащий файлы GeoIP с хоста. Тогда вам не нужно будет беспокоиться ни о чём другом в этом каталоге.