Eso es correcto. El plugin actualmente no está haciendo nada para manejar la eliminación de temas que ha publicado en Discourse. Sería posible configurar el plugin (o hacer que pregunte al administrador del sitio para que lo configure) un webhook de “Tema eliminado” en Discourse y luego usar las solicitudes de ese webhook para eliminar los metadatos que asocian una publicación de WordPress con un tema de Discourse.
No pretendo responder todas tus preguntas relacionadas con WordPress, ¡pero he trabajado mucho con el plugin WP Discourse en el pasado 