その通りです。このプラグインは現在、Discourseに公開されたトピックの削除を処理する機能を持っていません。プラグインを設定して（またはサイト管理者に設定を依頼して）Discourseに「トピックが削除された」Webhookを設定し、そのWebhookからのリクエストを使用してWordPressの投稿とDiscourseのトピックを関連付けるメタデータを削除することは可能です。
WordPress関連の質問にすべて答えるつもりはありませんが、過去にWP Discourseプラグインで多くの作業を行いました 