O Discourse foi projetado para lidar com HTML no conteúdo bruto das postagens. A menos que você esteja vendo entidades HTML na versão publicada (ou seja, o que aparece no tópico quando você o está lendo), é assim que ele foi projetado para funcionar e funciona com sucesso para muitas combinações de Wordpress / Discourse.
Você pode personalizar o HTML que é publicado no Discourse usando as dicas descritas aqui:
O motivo pelo qual é HTML em vez de markdown é explicado mais detalhadamente aqui: