明瞭な説明をありがとう、Loukasさん。関連するコードを確認しましたが、プラグインにいくつかの調整を加える余地はありそうです。ただし、一括更新を行う方法が複数存在し、自動公開機能が「自動的」に動作するように設計されていることを考慮すると、いくつかのトレードオフが生じます。必ずしもあなたのケースで問題となるわけではありませんが、他のケースでは問題になる可能性があります。
このため、一括操作を実行する際は、自動公開機能を無効にするのが解決策です。プラグイン全体を無効にする必要はありません。もしこれが何らかの理由で面倒だと感じたり、TaxoPressや他の一括更新方法で同様の問題が発生したりした場合は、こちらに戻ってきてください。再度調査いたします。