У TL4 есть доступ к массовым действиям для обновления уведомлений, но, к сожалению, у TL3 и ниже сейчас такой возможности нет. 
Для всех пользователей на представлениях unread и new есть кнопка массовых действий, где можно выбрать конкретные новые/непрочитанные темы и использовать кнопку «Отклонить», чтобы пометить их как прочитанные. Там также есть дополнительный флажок «прекратить отслеживание», чтобы одновременно сбросить их в статус «Обычный». Подойдёт ли это в данном случае?