Процедура обновления стандартных плагинов

Из любопытства — зачем вам форкать какие-либо официальные плагины?

В любом случае в app.yml можно выполнить команду для удаления конкретного директории плагина, а затем клонировать свой собственный, если это абсолютно необходимо, например:

<in after_code: somewhere>
    - exec:
        cd: $home/plugins
        cmd:
          - rm -r poll
    - exec:
        cd: $home/plugins
        cmd:
          - git clone https://github.com/myaccount/myplugin-replacement.git

Возможно, получится сделать так, но проверьте:

<in after_code: somewhere>
    - exec:
        cd: $home/plugins
        cmd:
          - rm -r poll
          - git clone https://github.com/myaccount/myplugin-replacement.git

Я не был особенно внимателен к пробелам — убедитесь, что отступы идеальны.