Плагин документации — индексная тема не работает после восстановления

Нет, эта задача rake — это разовое действие на дату упомянутого сообщения.

Вам не следует создавать тему заново. Достаточно зайти в настройки категории, отменить привязку, сохранить и снова привязать существующую тему — это должно сработать.