Добавление двух тильд до и после ссылки не зачеркивает её

Проблема в том, что ~~ в конце не отделены от ссылки. Может быть трудно решить, являются ли они частью ссылки или частью форматирования.

__https://meta.discourse.org/t/horizon-theme/360486/1__ тоже не работает __https://meta.discourse.org/t/horizon-theme/360486/1__

Вместо этого вы можете использовать один из следующих вариантов:

~~[Horizon Theme](https://meta.discourse.org/t/horizon-theme/360486/1)~~
[s]https://meta.discourse.org/t/horizon-theme/360486/1 [/s]
<s>https://meta.discourse.org/t/horizon-theme/360486/1 </s>

Horizon Theme
Horizon Theme
Horizon Theme