もし私がそのコミュニティの運営者なら、まず個別にテストすると思います。一方で、コミュニティ全体で有効にすれば、より早く価値のあるフィードバックが得られるかもしれません 
。冗談はさておき、個別にテストするのは賢明だと思いますが、ここでは破壊的なデータ移行は発生しません。安全に有効化・無効化が可能です。ここで下す決断によって、どちらの方向にもロックされることはありません。
この部分については、たぶん偶然にもすでに答えちゃいましたね！ネスト機能を有効にすると、データベース内の各トピックに対して nested_topic レコードが作成され、祖先ツリーに沿って返信数を計算するジョブが開始されます。ネスト機能を無効にすると、その nested_topic レコードが削除され、フラットな状態に戻ります。問題はありません。
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