Похоже, что в меню присутствуют и Руководство, и FAQ — именно это, вероятно, вызывает переполнение. Если я добавлю FAQ на свой сайт, происходит то же самое.
Небольшое дополнение CSS может помочь переносить строки:
.nav-pills {
flex-wrap: wrap;
}
Уменьшение gap для .nav-pills также может немного помочь.
(Это был всего лишь быстрый тест с использованием инструментов разработчика браузера. Возможно, вам потребуется сделать селекторы более конкретными, если вы не хотите затрагивать .nav-pills в других местах.)