Isso é potencialmente viável, mas um pouco complicado. No momento, não adicionamos a troca automática do modo escuro ao endpoint de comentários incorporados. Podemos adicionar isso, e funcionaria se o seu site Ghost estivesse alternando automaticamente para o modo escuro quando o navegador muda para o modo escuro. Mas, pelo que pude perceber, o seu site Ghost usa um botão de modo escuro, o que não funcionará com a implementação do Discourse.
O que você pode fazer no seu caso específico é alternar uma classe no iframe de comentários incorporados do Discourse ao clicar no botão e, em seguida, usar essa classe para alternar as cores no seu estilo incorporado.