Gestisco un server multisito da circa due anni e non ho mai avuto un plugin che si rompesse solo a causa del multisite.
Alcuni avvertimenti: lo gestisco per temi di staging, non per la produzione. Quindi probabilmente non entro nei dettagli di ogni plugin. Inoltre, non ho mai usato Data Explorer su istanze aggiuntive. Tuttavia, ricostruisco frequentemente e ho un bel elenco di plugin in continua evoluzione.