Benvenuto Daniel! 
Non conosco Pendo, ma se si tratta solo di uno snippet JavaScript da aggiungere, dovresti essere in grado di aggiungerlo dal pannello di amministrazione del tuo Discourse:
Personalizza → Temi (o Componenti, che potrebbe essere più pratico per crearne uno nuovo se il tuo forum ha più temi) → Modifica CSS/HTML → scheda Head.
Fammi sapere se Pendo necessita di altro 