Да, но вам действительно не стоит форкать Discourse и затем пытаться подтянуть все коммиты. Все, кто это делал, очень сожалеют об этом.
Хм. Но если речь идет только об одном файле, вы теоретически могли бы настроить ваш app.yml так, чтобы он копировал файл откуда-то в /var/www/discourse сразу после клонирования Discourse. Мне кажется, я уже делал так, чтобы изменить лимиты в настройках сайта.