Enfrentei uma situação semelhante esta manhã, mas consegui simplesmente reiniciar o aplicativo.
Meu site tem cerca de 10 temas, todos usando o componente Alternative Logos desde que cada tema usa logotipos de cores diferentes para combinar com sua paleta de cores. Vejo que agora posso inserir os logotipos do tema escuro nas configurações do site. No entanto, se eu excluir esse componente obsoleto, onde devo adicionar todos os outros logotipos personalizados para os demais temas?