Cara! Você é demais! Resolvido.
Percebi que, ao passar o mouse, o link não muda a cor de fundo como todos os outros no Discourse. Tentei fazer uma gambiarra com CSS para cobrir isso, o que funciona bem o suficiente:
.custom-header-links .headerLink a:hover {
background-color: #343434
}
Seria bom incluir isso no CSS do componente do tema, mas sou muito desajeitado para fazer isso. Talvez seja hora de ir para o GitHub, né?