Мы используем преобразование sass для $header_primary, поэтому, полагаю, это описание лишь частично верно.
До перехода на SVG мы использовали цвет $header_primary по умолчанию с уменьшенной непрозрачностью (что было немного ближе к ожидаемому), но в Safari возникали проблемы с непрозрачностью и SVG.
Это уже не раз обсуждалось (How to Change Header Icon Color? - #4 by awesomerobot), так что стоит подумать о том, как это улучшить.