@Lilly tiene toda la razón.
No debes bloquear las actualizaciones que provienen de upstream (correcciones de errores, parches de seguridad, incluso nuevas funciones), por lo que es mejor aplicar personalizaciones con un plugin (si necesitas modificar el backend) o un componente de tema (si solo el frontend)
Si empiezas a intentar mantener una bifurcación, pronto descubrirás que consume mucho tiempo.