Все настройки заменяются, за исключением тех, которые заданы в файле yml. См. Настройка провайдера объектного хранилища, совместимого с S3, для загрузок, чтобы узнать, как это сделать. Кроме того, это удобный способ восстановить одну резервную копию на другом сервере. Также есть тема о настройке тестового сервера с примерами: Настройка тестового сервера.