DiscourseはAPIレールアプリではなく、レールで作られた通常のアプリだと見かけました。Emberをフロントエンドとして、レールのみをAPI（バックエンド）として使用しているのではないでしょうか？この選択には何か理由がありますか？
その通りです。
時折、JavaScriptがサポートされていない、または（クローラーなど）で不要な場合に、Railsがテンプレートを提供するために使用されることがあります。
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