OK, ho delle ottime notizie e delle notizie frustranti.
Innanzitutto, hai assolutamente ragione sul fatto che l’aggiunta del funnel posiziona quei file nel posto giusto. Ho aggiunto il funnel al mio branch e ora funziona benissimo senza la dipendenza dal CDN. 
Sfortunatamente, al momento non riesco a eseguire il tuo codice. Ogni volta che navigo su una pagina con della matematica, la matematica non viene renderizzata e vedo il seguente messaggio di errore nella console:
Uncaught (in promise) Error: State EXPLORER already exists
Sono sicuro di aver fatto funzionare il tuo codice prima, quindi suppongo sia qualcosa che ho fatto io. Per essere chiari, ho letteralmente iniziato una directory completamente nuova usando le tecniche descritte in Install Discourse on macOS for development.
git clone https://github.com/discourse/discourse.git ./discourse
cd ./discourse
bundle install
pnpm install
bundle exec rake db:create
bundle exec rake db:migrate
RAILS_ENV=test bundle exec rake db:create db:migrate
# In un terminale
bundle exec rails server
# In un altro terminale
bin/ember-cli
Poi ho preso il tuo codice con
git checkout 71ad0305f812311f2a4570edf7c33f97de46c457
git switch -c mathjax-sam
Anche da questa configurazione fresca, ottengo l’errore.
A questo punto, sono abbastanza soddisfatto della mia versione del codice ma ancora curioso di sapere cosa sta succedendo con la tua. Devo prendermi una pausa da questo per le vacanze, però. Sarò felice di dare un’altra occhiata tra qualche giorno.
Un ultimo punto, però: per quanto ne so,
await import("tex-mml-chtml.js") // seguito da
await import("input/asciimath.js")
non dovrebbe funzionare, che è di fatto quello che il tuo codice sta facendo, credo.
Sono impreciso con i percorsi lì, ma il mio punto è che non so che chiamate dinamiche consecutive a import portino alla corretta struttura di MathJax. Penso che caricare i componenti di MathJax sia piuttosto complicato ed è per questo che hanno un processo di caricamento così dettagliato con l’oggetto MathJax e tutto il resto.
Grazie mille per il tuo aiuto e la tua pazienza @sam!