標準インストールでは、システムにインストールされている nginx は使用されません。ホストに nginx がインストールされている場合、Discourse はポート 80 および 443 にアクセスできません。システムに nginx をインストールすることで、Discourse が標準設定で動作するのを妨げています。
これは Amazon には関係ありません。単なる Linux システム管理の問題です。
（Setting up offline page のように、システムに nginx をインストールすることが適切な場合もありますが、そのためには Linux におけるポートの仕組みを理解する必要があります。
したがって、現在の状況が理解できない場合は、そこから始めないでください！）