Sí. Todos los modelos de permisos del foro siguen vigentes, por lo que los usuarios necesitarían ser miembros del foro para comentar en la ventana incrustada. Por supuesto, el tema tendría que ser público para permitir que los comentarios sean visibles para los visitantes.
La forma en que restringes la membresía de tu foro (solo por invitación, requiere aprobación, etc.) sigue siendo completamente a tu criterio.