Я думаю, что с помощью навыков дизайнера вы сможете сделать так, чтобы эти две части выглядели как единое целое. Например, https://www.sitepoint.com/ работает на WordPress, а https://www.sitepoint.com/community/ — на Discourse. Навигация в шапке совпадает (по крайней мере, на мой взгляд как у разработчика), и обе части содержат ссылки друг на друга. Представляю, что добиться полной идентичности макетов может быть сложно (например, двухколоночный без подвала против четырёхколоночного с двухколоночным подвалом и т.д.), но, на мой взгляд, добиться соответствия цветовой палитры и логотипов с помощью CSS вполне реально. Есть некоторые функциональные различия, но, по моему мнению, посетитель вряд ли столкнётся с трудностями при понимании того, что эти две части принадлежат одному проекту. — Встраивание не требуется.