Ho recuperato un altro backup dal sito e ho provato a ripristinarlo tramite terminale seguendo questa guida: Restore a backup from the command line. Ma alla fine del ripristino ho ricevuto lo stesso errore nel terminale:
Notifying 'system' of the end of the restore...
Something went wrong while notifying user.
Finished!
[FAILED]
Restore done.
Visto che i backup erano corretti, immagino si tratti di un bug.