Как-то не знал об этом. Сразу решил мою проблему, большое спасибо!
Кстати, рабочий запрос:
SELECT users.id AS user_id, user_emails.email
FROM users
LEFT JOIN user_emails ON users.id = user_emails.user_id AND user_emails.primary
WHERE users.id IN (/* список ID пользователей здесь, например 1,2,3 */)