Por alguna razón no sabía eso. Resolvió mi problema inmediatamente, ¡muchas gracias!
Por cierto, la consulta que sugirió es
SELECT users.id AS user_id, user_emails.email
FROM users
LEFT JOIN user_emails ON users.id = user_emails.user_id AND user_emails.primary
WHERE users.id IN (/* lista de IDs de usuario aquí, p. ej. 1,2,3 */)