これはコミュニティ固有の問題であり、ご自身がおっしゃる通り、意図しない衝突は発生します。少数の非常に長いトピックが存在することにはどのような価値があるのでしょうか？
メタのようなコミュニティの場合、「Mailgun の設定に関する問題」という件名でメールを送信したユーザーは、問題を解決してから数ヶ月、あるいは数年経っても更新通知を受け取り続けることになります。これは現実的ではないでしょう。
目標は重複したタイトルを避けることです。現在の設定では、サイト内でトピックを作成する際にユーザーにフィードバックを与えることができるため、この制約が適用されます。しかし、メールで送信してくるユーザーの場合、そのような機会がないため、この設定は尊重されません。