Cloudflare が壊れているわけではありません。実装に問題がありました。
CloudFlare がプロキシしている間は、Let’s Encrypt は証明書を発行しません。検証が完了しないためです。
Discourse では、すでに minify されたコードを変更してしまうため、CloudFlare の「パフォーマンス」機能のいずれも使用できません。
CloudFlare があなたに提供できるのは、IP アドレスを隠蔽し、アップロード用の CDN として機能することだけです。メリットは最小限です。