Фавикон и другие значки сайта загружаются по HTTP, хотя сам сайт работает по HTTPS. Chrome способен обновлять эти запросы до HTTPS, но фавикон остаётся по HTTP, и в консоли появляется ошибка.
РЕДАКТИРОВАНИЕ: Принудительный HTTPS был отключён в настройках. Включение этой опции решило проблему.