Quelques messages privés manqués plus tard, JammyDodger et moi avons pu repérer un schéma 
La notification est manquante lorsque le message est une réponse à un autre message.
Un exemple :
Voici 3 messages de chat que Nat m’a envoyés :
Le matin, j’ai reçu 2 notifications par e-mail
Il n’y a pas d’e-mail pour le deuxième message, qui était la réponse à un message précédent.
J’ai également une capture d’écran montrant les notifications de 2 nouveaux messages de chat sur l’icône dans l’en-tête. (J’étais content qu’il n’y ait pas de notification concernant les badges, j’ai donc pris une capture d’écran de mes notifications. C’est une heureuse coïncidence que le nombre de notifications de chat soit inclus.)
Le problème est donc le suivant : chaque fois que Nat répond à un autre message dans notre chat, je ne suis pas notifié 