Você pode compartilhar os comandos exatos que está executando e a saída que está vendo (sinta-se à vontade para ocultar endereços IP/nomes de host se preferir)? /var/www/discourse parece indicar que você está dentro do contêiner Docker, e não no seu servidor.
Você deveria fazer algo como:
ssh user@forum.example.com
cd /var/discourse
git pull
sudo ./launcher rebuild app