Para esta reconstrucción en particular, necesitaste descargar una nueva imagen base, como se muestra en las líneas WARNING hasta Status en tu captura de pantalla. Esta es grande, 2,81 GB según mi sistema, por lo que lo que estás viendo es el espacio perdido por esta nueva versión de la imagen base.
# docker images -a
REPOSITORY TAG IMAGE ID CREATED SIZE
discourse/base latest ab71a5d97460 4 days ago 2.81GB
Usar ./launcher cleanup limpiará contenedores e imágenes no utilizados, lo que puede recuperar suficiente espacio y, como dijo @pfaffman, la poda directa con docker puede liberar más objetos no utilizados, aunque personalmente no he visto ningún beneficio significativo más allá de los contenedores e imágenes.
Otra cosa que puede ayudar es limpiar la caché de apt, que puede volverse bastante grande.
apt-get clean