Один из доменов, который я использовал в конфигурации мультисайта, не работал, потому что срок действия имени домена истек, и это вызывало ошибку до того, как обрабатывался новый под-поддомен.
Как только я изменил истекшее имя домена и добавил A-запись для нового имени домена, проблема разрешилась сама собой.