Загрузка групп вызывает ошибку внутреннего сервера

Вы пробовали безопасный режим? Также стоит проверить свои логи и, вероятно, предоставить их.

Даже с ними я лично не смогу вам помочь, но без проверки этих двух пунктов мало кто сможет вам помочь.

Мой личный экземпляр с самостоятельным хостингом и управляемый мной экземпляр CDCK оба корректно загружают файлы JSON групп (я только что проверил), когда используются последние версии.