Te has encontrado con un error conocido (aunque poco común) que fue corregido en el commit anterior. Sin embargo, ese commit aún no está incluido en una versión estable de Discourse.
Configurar temporalmente recompress original jpg quality en 100 debería evitar que se produzca la conversión.
(…y/o podrías intentar reducir la calidad del PNG que estás exportando para que sea inferior al valor del ajuste recompress original jpg quality.)
¡Solo asegúrate de devolver ese ajuste a su valor anterior después de haber subido tu logotipo!