El video de YouTube parece comportarse igual en Safari móvil y en la PWA: no puedes reproducirlo en segundo plano ni en la pantalla de bloqueo. Eso podría deberse a que YouTube tiene restricciones particulares (por ejemplo, bloquean la reproducción en segundo plano a menos que te suscribas a YouTube Premium), lo cual podría afectar este caso.
Aquí tienes otros ejemplos:
Incrustación de Vimeo:
https://vimeo.com/175708185
Y una incrustación de audio:
En mi iPhone, ambos funcionan como describí:
–En Safari móvil, puedes reproducir ambos en segundo plano y en la pantalla de bloqueo (la única diferencia es que el video deja de reproducirse cuando el teléfono cambia al estado de bloqueo o fondo, y debes pulsar reproducir de nuevo).
–En la PWA, ninguno se reproduce en segundo plano ni en la pantalla de bloqueo (no hay ninguna opción de reproducción adicional en ninguno de los casos una vez que la aplicación pasa al fondo o el teléfono se bloquea).