Muchas gracias @supermathie
Haré la copia de seguridad/restauración sin cambiar los nombres de los buckets como también sugirió @RGJ. Como dije, mi preocupación era no afectar los datos existentes del servidor de ninguna manera, pero si hago una copia de seguridad de los buckets existentes primero y me aseguro de que el servidor existente esté en modo de solo lectura durante la migración, creo que la integridad de los datos subidos en los buckets está bastante bien protegida.