Спасибо за ваш ответ!
Тем временем я обнаружил причину проблемы в таблице post_timings в базе данных. В этой таблице хранится информация о том, какие посты пользователи уже прочитали в темах. При неизвестных мне обстоятельствах сервер может пытаться записать в таблицу записи, которые уже существуют.
Я искал в логах и нашёл упоминание этой таблицы базы данных. К сожалению, я больше не помню, какие именно логи я просматривал… 
Моим решением было просто очистить содержимое таблицы. Все пользователи потеряли прогресс чтения тем, и некоторым пришлось написать новый пост в существующих темах, чтобы перезаписать кэшированные браузером данные. У меня очень маленький форум, всего около 20 пользователей, поэтому я не думаю, что это решение подойдёт для форума с большим количеством пользователей 
С уважением, Ронни