これは正しくありません。無効化されたユーザーは即座にユーザーディレクトリから削除されるわけではありませんが、ユーザーディレクトリを更新するジョブが実行された際に削除されるはずです。このジョブは1日に1回実行されます。
ユーザーディレクトリからユーザーを追加・削除するコードは、ユーザーが「アクティブ」であることを確認します。つまり、一度サイトでアクティブだった非アクティブユーザーは、無効化から1日以内にユーザーディレクトリから削除されるはずです。サイト上で一度もアクティブになったことがないユーザー（例えば、サインアップ後にアクティベーションメールに応答しないユーザー）は、ユーザーディレクトリに表示されることはありません。
「ユーザーの承認が必要」サイトの設定を有効にしているサイトの場合、承認されていないユーザーはユーザーディレクトリに追加されません。
もしあなたのサイトでこれが当てはまらない場合は、お知らせください。