私も同様の問題に直面しています。これは Failed to bootstrap using import template と同じようです。
本来は、この問題を目にしたのでそのコンテナのアップグレードを試すつもりはなかったのですが、別の奇妙なエラーがあったため、試してしまいました。
編集：テンプレート内の
su discourse -c 'bundle config unset deployment'
の行を、
su discourse -c 'bundle install --no-deployment --path vendor/bundle --jobs 4 --without "test development"'
の行の前に追加したところ、動作するようになりました。（ただし、残念ながら私の無関係な問題は解決しませんでした）。