Creo que el número de notificaciones debería desaparecer una vez que haga clic para verlas, independientemente de si las he abierto o no.
Por comodidad, puedo explicar el dilema psicológico que surge debido al comportamiento actual.
Si el equipo aún no está convencido, piensen en Facebook, Google, LinkedIn y todos esos grandes nombres. Por ejemplo, si tienes +99 notificaciones de Gmail, el contador se restablecerá al hacer clic, incluso si la anidación de la página solo permite mostrar 10 notificaciones a la vez.