Olá, Chris! Você já conferiu suas preferências de usuário? É lá que você pode definir se deseja ou não receber e-mails quando for notificado.
A “privacidade” das mensagens diretas foi discutida exaustivamente aqui — talvez valha a pena usar a busca. Como em qualquer sistema, não acho que os usuários esperem que os administradores não possam ver suas mensagens… se pensam isso, estão profundamente enganados. A única maneira de evitar isso é com chaves de criptografia, que, creio eu, estão disponíveis como um plugin — Discourse Encrypt (deprecated) — embora eu ainda não tenha testado.
Aqui no meta, há muitos administradores que podem ver tudo… na minha comunidade, é apenas uma pessoa. Moderadores não veem mensagens diretas, exceto as próprias.