¡Parece que lo arreglaste tú mismo! Eso es bueno saberlo.
Para cualquier otra persona que esté leyendo esto: hubo un error que se introdujo poco después de v2.6.0.beta1. Lo corregí en FIX: Backups should use relative paths for local uploads · discourse/discourse@f51ccea · GitHub y lo llevé a la rama beta.
A partir de ahora, las copias de seguridad se crearán correctamente nuevamente y la restauración de una copia de seguridad creada en el periodo entre v2.6.0.beta1 y la corrección del error también funcionará.