Grazie Jay
Sono riuscito a ricostruire e rimettere online il mio sito web.
Innanzitutto, come hai suggerito, la soluzione è reindicizzare, correggere e ripetere finché non è fatto. Ho usato il seguente comando per vedere quanti
SELECT username_lower, count(*) from users GROUP by username_lower HAVING count(*) > 1;
mi stava dando zero.
Ovviamente ci sono molti duplicati e volevo sapere quanti. quindi ho leggermente modificato la query:
SELECT username_lower, count(username) from users GROUP by username_lower HAVING count(username) > 1;
Questo ha funzionato e ha restituito circa 50 duplicati, quindi li ho corretti, reindicizzati e ricostruiti con successo.