Locations を無効化した場合（YML ファイルでコメントアウトして再ビルドする）、ヘッダーリンクコンポーネントは再び機能し始めるでしょうか？
@davidkingham の通り、Locations には最新のテストをパスしたバージョンでいくつかの問題があります。また、ここで言及されている通り：
テーマコンポーネントやプラグインに関する問題は、Support ではなく、それぞれのトピックに投稿することをお勧めします。Support は通常、コアに関連する問題を取り扱います。多くのプラグインはサードパーティ製であるため、問題に気づいてもらうには、それぞれのトピックに参加して報告するしかないことを覚えておいてください。