Vielen Dank an @thoka und @pfaffman für Ihre Zeit und Ihre Antworten.
Ich habe inzwischen den git restore durchgeführt.
Da Jay darauf hingewiesen hat, dass Leute keine benutzerdefinierten Zertifikate mehr verwenden, sehe ich zu diesem Zeitpunkt auch keinen dringenden Bedarf dafür.
Ich habe erneut ./launcher rebuild app ausgeführt und der Launcher lief ohne Probleme.
Nebenbei bemerkt: Ich habe lediglich die Cloudflare-Vorlage am Ende von app.yml wie angewiesen eingefügt, aber der Launcher meldete einen Syntaxfehler. Ich habe sie entfernt und alles ist in Ordnung. Ich hatte nie Probleme mit Cloudflare ohne die Cloudflare-Vorlage, also mache ich einfach weiter so.